Ärendet behandlas som försök till mord.
Larmet nådde polisen strax innan halv två under natten mot torsdagen.
Boende i området vid Sandhamnsplan på Gärdet i centrala Stockholm hade hört vad de uppfattade som skottlossning.
Larmet orsakade ett rejält polisuppbåd och området spärrades av.
Vid 6-tiden på morgonen påträffades skotthål i en fastighet och man har inlett en förundersökning om försök till mord.
Ingen människa skadades i skottlossningen.
Polisen har ännu inga misstänkta.